かつて国文学者吉田幸一の所蔵であったことから「吉田本（源氏物語）」、また、吉田の旧蔵書を中心に編成された「古典文庫」の管理となっていたことから「古典文庫本（源氏物語）」と呼ばれることもある。

【第８９代 後深草(ごふかくさ)天皇】
異名：　久仁（ひさひと）
生没年：寛元元年（1243） ～　嘉元２年（1304）（６２歳）
在位：　寛元４年（1246） ～　正元元年（1259）
父：　　後嵯峨天皇　第３皇子
母：　　西園寺成子（太上大臣・西園寺実氏の娘）
皇后：　藤原（西園寺）公子
皇妃：　藤原(洞院) 諳子、藤原相子、藤原房子、藤原成子、三善衡子
皇子女：貴子内親王、熙仁親王(伏見天皇)、性仁親王、幸仁親王、久子内親王、行覚親王、深性親王、久明親王(鎌倉幕府８代将軍)、恒助親王、永子内親王、増覚親王
皇宮：　平安京（へいあんきょう：京都府京都市）
【第９２代 伏見(ふしみ)天皇】
異名：　熙仁（ひろひと）
生没年：文永２年（1265）　～　文保元年（1317）（５３歳）
在位：　弘安１１年（1288）～　永仁６年（1298）
父：　　後深草天皇　第１皇子
母：　　藤原(洞院) 諳子（玄輝門院：左大臣洞院実雄の女）
皇后：　藤原（西園寺）■子（西園寺実兼の娘：永福門院）
皇妃：　藤原経子、洞院季子、五辻経子、三善衡子、藤原守子、藤原英子
皇子女：胤仁親王(後伏見天皇)、誉子内親王、寛性親王、恵助親王、延子内親王、富仁親王(花園天皇)、尊円親王、尊悟親王、寛胤親王、道熙親王、尊熙親王、聖珍親王、進子内親王
【第９３代　後伏見(ごふしみ)天皇】
異名：　胤仁（たねひと）
生没年：弘安１１年（1288）　～　延元元年（1336）（４９歳）
在位：　永仁６年（1298）～　正安３年（1301）
父：　　伏見天皇　第１皇子
母：　　藤原（五辻）経子（参議・藤原経氏の娘）
皇后：　藤原(西園寺) 寧子（左大臣・西園寺公衡の娘）
皇妃：　藤原守子、藤原氏、高階邦子、治部卿局、右京大夫局
皇子女：尊胤親王、法守親王、珣子内親王、量仁親王(光厳天皇)、尊実親王、景仁親王、承胤親王、長助親王、亮性親王、豊仁親王(光明天皇)、尊道親王、覚公
【北朝４代　後光厳（ごこうごん）天皇】
異名：　彌仁（いやひと）
生没年：延元３年（1336）　～　文中３年（1374）（３７歳）
在位：　正平８年（1353）　～　建徳２年（1371）
父：　　光厳天皇
母：　　三条秀子
皇后：　藤原（紀）仲子（崇賢門院、中納言典侍：父は石清水八幡宮祠官法印通清）
皇妃：　藤原氏、橘氏、右衛門佐局
皇子女：亮仁親王、緒仁親王(後円融天皇)、行助親王、覚叡親王、永助親王、堯仁親王、覚増親王、道円親王、寛守親王、明承親王、寛教親王、聖助親王、堯性親王、治子内親王、見子内親王、秀仁
【北朝５代　後円融（ごえんゆう）天皇】
異名：　緒仁（おひと）
生没年：正平１３年（1358）　～　明徳４年（1393）（３６歳）
在位：　文中３年（1374）　　～　弘和２年（1382）
父：　　後光厳天皇　第２皇子
母：　　紀仲子
皇后：　藤原（三条）厳子（通陽門院）
皇妃：　藤原今子、右衛門佐局
皇子女：幹仁(後小松天皇)、道朝親王、珪子内親王
【第１０１代　称光（しょうこう)天皇】
異名：　躬仁（みひと）
生没年：応永８年（1401）　～　正長元年（1428）（２８歳）
在位：　応永２１年（1414）～　正長元年（1428）
父：　　後小松天皇
母：　　日野西資子
皇后：　
皇妃：　日野光子、藤原氏、源氏、鴨氏
皇子女：胤仁親王(後伏見天皇)、誉子内親王、寛性親王、恵助親王、延子内親王、富仁親王(花園天皇)、尊円親王、尊悟親王、寛胤親王、道熙親王、尊熙親王、聖珍親王、進子内親王
【第１０３代　後土御門（ごつちみかど)天皇】
異名：　成仁（ふさひと）
生没年：嘉吉２年（1442）　～　明応９年（1500）（５９歳）
在位：　寛正６年（1465）　～　明応９年（1500）
父：　　後花園天皇
母：　　藤原信子
皇后：　庭田朝子
皇妃：　藤原房子、藤原兼子
皇子女：　勝仁親王(後柏原天皇)、尊伝親王、応善、仁悟親王、皇女某、智円、理秀
【第１０４代　後柏原（ごかしわばら）天皇】
異名：　勝仁（かつひと）
生没年：寛正５年（1464）　～　大永６年（1526）（６３歳）
在位：　永正１８年（1521）～　大永６年（1526）
父：　　後土御門天皇
母：　　庭田朝子
皇妃：　勧修寺藤子、源源子、藤原継子
皇子女：覚鎮、知仁親王(後奈良天皇)、覚道親王、道喜、尊鎮親王、覚音、彦胤親王
【第１０５代　後奈良（ごなら）天皇】
異名：　知仁（ともひと）
生没年：明応５年（1496）　～　弘治３年（1557）（６２歳）
在位：　天文５年（1536）　～　弘治３年（1557）
父：　　後柏原天皇　第２皇子
母：　　勧修寺藤子　（豊楽門院）
皇后：　万里小路栄子
皇妃：　藤原国子、藤原量子、藤原具子、小槻氏、王氏
皇子女：覚恕、方仁親王(正親町天皇)、永寿、皇女某、皇女某、皇子某、普光、聖秀、春齢
【第１０６代　正親町(おおぎまち）天皇】
異名：　方仁（みちひと）
生没年：永正１４年（1517） ～　文禄２年（1593）（７７歳）
在位：　永禄３年（1560）　 ～　天正１４年（1586）
父：　　後奈良天皇
母：　　西園寺成子
皇后：　万里小路栄子
皇妃：　万里小路房子、藤原氏、
皇子女：永高、皇女某、誠仁親王
【第１０７代　後陽成（ごようぜい)天皇】
異名：　和仁（かずひと）
生没年：元亀２年（1571）　～　元和３年（1617）（４７歳）
在位：　天正１４年（1586）～　慶長１６年（1611）
父：　　誠仁親王
母：　　勧修寺晴子
皇后：　西園寺房子
皇妃：　近衛前子、藤原輝子、藤原親子、藤原宣子、藤原孝子、源具子、平時子、清原胤子、大中臣氏
皇子女：覚深親王、聖興、承快親王、文高女王、清子内親王、政仁親王(後水尾天皇)、尊英、尊性親王、堯然親王、好仁親王、良純親王、貞子内親王、尊覚親王、永宗女王、道晃親王、道周親王、尊清、慈胤親王